MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp26

Total Repeats: 668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017395	TAA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825555
2	NC_017395	ACA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825555
3	NC_017395	ATA	2	6	122	127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825555
4	NC_017395	A	6	6	147	152	100 %	0 %	0 %	0 %	387825555
5	NC_017395	CTTT	2	8	182	189	0 %	75 %	0 %	25 %	387825555
6	NC_017395	A	6	6	208	213	100 %	0 %	0 %	0 %	387825555
7	NC_017395	ATT	2	6	222	227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825555
8	NC_017395	A	6	6	263	268	100 %	0 %	0 %	0 %	387825555
9	NC_017395	TAT	2	6	316	321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825555
10	NC_017395	T	6	6	363	368	0 %	100 %	0 %	0 %	387825556
11	NC_017395	AC	3	6	412	417	50 %	0 %	0 %	50 %	387825556
12	NC_017395	A	7	7	425	431	100 %	0 %	0 %	0 %	387825556
13	NC_017395	A	6	6	478	483	100 %	0 %	0 %	0 %	387825556
14	NC_017395	A	6	6	540	545	100 %	0 %	0 %	0 %	387825556
15	NC_017395	T	6	6	599	604	0 %	100 %	0 %	0 %	387825556
16	NC_017395	AAAT	2	8	624	631	75 %	25 %	0 %	0 %	387825556
17	NC_017395	CTG	2	6	646	651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825556
18	NC_017395	T	7	7	721	727	0 %	100 %	0 %	0 %	387825556
19	NC_017395	A	7	7	728	734	100 %	0 %	0 %	0 %	387825556
20	NC_017395	ATT	2	6	859	864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
21	NC_017395	TA	3	6	885	890	50 %	50 %	0 %	0 %	387825557
22	NC_017395	ATC	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825557
23	NC_017395	AT	3	6	1031	1036	50 %	50 %	0 %	0 %	387825557
24	NC_017395	TTA	2	6	1046	1051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
25	NC_017395	TAA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825557
26	NC_017395	TAT	2	6	1142	1147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
27	NC_017395	GTT	2	6	1198	1203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825557
28	NC_017395	AAT	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825557
29	NC_017395	AGAC	2	8	1313	1320	50 %	0 %	25 %	25 %	387825557
30	NC_017395	ATT	2	6	1338	1343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
31	NC_017395	TAT	2	6	1364	1369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
32	NC_017395	AGA	2	6	1386	1391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825557
33	NC_017395	AATT	2	8	1448	1455	50 %	50 %	0 %	0 %	387825557
34	NC_017395	AAC	2	6	1485	1490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825557
35	NC_017395	ATT	2	6	1503	1508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
36	NC_017395	T	6	6	1516	1521	0 %	100 %	0 %	0 %	387825557
37	NC_017395	GAC	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825557
38	NC_017395	ATT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
39	NC_017395	AATT	2	8	1688	1695	50 %	50 %	0 %	0 %	387825557
40	NC_017395	T	6	6	1730	1735	0 %	100 %	0 %	0 %	387825557
41	NC_017395	ACAA	2	8	1780	1787	75 %	0 %	0 %	25 %	387825557
42	NC_017395	TCA	2	6	1816	1821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825557
43	NC_017395	ATTTG	2	10	1825	1834	20 %	60 %	20 %	0 %	387825557
44	NC_017395	T	8	8	1853	1860	0 %	100 %	0 %	0 %	387825557
45	NC_017395	T	6	6	1879	1884	0 %	100 %	0 %	0 %	387825557
46	NC_017395	TTC	2	6	1895	1900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825557
47	NC_017395	A	7	7	1910	1916	100 %	0 %	0 %	0 %	387825557
48	NC_017395	A	6	6	1918	1923	100 %	0 %	0 %	0 %	387825557
49	NC_017395	TAT	2	6	1925	1930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
50	NC_017395	AT	3	6	1963	1968	50 %	50 %	0 %	0 %	387825557
51	NC_017395	ATT	2	6	1975	1980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
52	NC_017395	ATT	2	6	2005	2010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825557
53	NC_017395	TTTC	2	8	2078	2085	0 %	75 %	0 %	25 %	387825557
54	NC_017395	T	6	6	2118	2123	0 %	100 %	0 %	0 %	387825557
55	NC_017395	T	6	6	2164	2169	0 %	100 %	0 %	0 %	387825557
56	NC_017395	TAA	2	6	2520	2525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825558
57	NC_017395	AAT	3	9	2555	2563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825558
58	NC_017395	A	8	8	2601	2608	100 %	0 %	0 %	0 %	387825558
59	NC_017395	AAT	2	6	2659	2664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825558
60	NC_017395	CAA	2	6	2688	2693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825558
61	NC_017395	A	6	6	2717	2722	100 %	0 %	0 %	0 %	387825558
62	NC_017395	ATA	2	6	2765	2770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825558
63	NC_017395	CAT	2	6	2845	2850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825558
64	NC_017395	CAC	2	6	2880	2885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825558
65	NC_017395	C	6	6	2912	2917	0 %	0 %	0 %	100 %	387825558
66	NC_017395	CAG	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825558
67	NC_017395	AAT	2	6	3004	3009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825558
68	NC_017395	ATA	2	6	3039	3044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825558
69	NC_017395	ATT	2	6	3122	3127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825558
70	NC_017395	CAA	2	6	3195	3200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825558
71	NC_017395	CAG	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825558
72	NC_017395	T	7	7	3269	3275	0 %	100 %	0 %	0 %	387825558
73	NC_017395	A	6	6	3303	3308	100 %	0 %	0 %	0 %	387825558
74	NC_017395	AGC	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825558
75	NC_017395	AAT	2	6	3316	3321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825558
76	NC_017395	AGC	2	6	3400	3405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825558
77	NC_017395	TCC	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387825558
78	NC_017395	ACA	2	6	3530	3535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825558
79	NC_017395	ATA	2	6	3545	3550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825558
80	NC_017395	TAAAA	2	10	3667	3676	80 %	20 %	0 %	0 %	387825558
81	NC_017395	A	7	7	4093	4099	100 %	0 %	0 %	0 %	387825559
82	NC_017395	TA	3	6	4100	4105	50 %	50 %	0 %	0 %	387825559
83	NC_017395	AGA	2	6	4110	4115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825559
84	NC_017395	TGT	2	6	4140	4145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825559
85	NC_017395	A	6	6	4243	4248	100 %	0 %	0 %	0 %	387825559
86	NC_017395	CA	3	6	4271	4276	50 %	0 %	0 %	50 %	387825559
87	NC_017395	ATA	2	6	4282	4287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825559
88	NC_017395	ATCA	2	8	4289	4296	50 %	25 %	0 %	25 %	387825559
89	NC_017395	TTTTA	2	10	4326	4335	20 %	80 %	0 %	0 %	387825559
90	NC_017395	GAA	2	6	4387	4392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825559
91	NC_017395	ATA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825559
92	NC_017395	A	7	7	4425	4431	100 %	0 %	0 %	0 %	387825559
93	NC_017395	A	6	6	4520	4525	100 %	0 %	0 %	0 %	387825560
94	NC_017395	CAA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825560
95	NC_017395	GTT	2	6	4590	4595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825560
96	NC_017395	CAC	2	6	4603	4608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825560
97	NC_017395	TAA	2	6	4619	4624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825560
98	NC_017395	A	7	7	4623	4629	100 %	0 %	0 %	0 %	387825560
99	NC_017395	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825560
100	NC_017395	AAT	2	6	4670	4675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825560
101	NC_017395	AATG	2	8	4697	4704	50 %	25 %	25 %	0 %	387825560
102	NC_017395	CAAT	2	8	4726	4733	50 %	25 %	0 %	25 %	387825560
103	NC_017395	AAGG	2	8	4759	4766	50 %	0 %	50 %	0 %	387825560
104	NC_017395	GAAA	2	8	4774	4781	75 %	0 %	25 %	0 %	387825561
105	NC_017395	ATT	2	6	4823	4828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825561
106	NC_017395	A	6	6	4839	4844	100 %	0 %	0 %	0 %	387825561
107	NC_017395	TAT	2	6	4957	4962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825561
108	NC_017395	ATT	2	6	5034	5039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825561
109	NC_017395	ATTAG	2	10	5063	5072	40 %	40 %	20 %	0 %	387825561
110	NC_017395	GAA	2	6	5093	5098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825561
111	NC_017395	ATAA	2	8	5153	5160	75 %	25 %	0 %	0 %	387825561
112	NC_017395	AAT	2	6	5173	5178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825561
113	NC_017395	A	6	6	5197	5202	100 %	0 %	0 %	0 %	387825561
114	NC_017395	ACA	2	6	5270	5275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825561
115	NC_017395	ATT	2	6	5289	5294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825561
116	NC_017395	TTA	2	6	5313	5318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825561
117	NC_017395	TAA	2	6	5323	5328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825561
118	NC_017395	AGA	2	6	5332	5337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825561
119	NC_017395	GAAA	2	8	5350	5357	75 %	0 %	25 %	0 %	387825561
120	NC_017395	AAG	2	6	5358	5363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825561
121	NC_017395	AAG	2	6	5427	5432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825561
122	NC_017395	A	7	7	5482	5488	100 %	0 %	0 %	0 %	387825561
123	NC_017395	AAT	2	6	5563	5568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825561
124	NC_017395	TAC	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825561
125	NC_017395	AAT	2	6	5645	5650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825561
126	NC_017395	A	6	6	5651	5656	100 %	0 %	0 %	0 %	387825561
127	NC_017395	A	6	6	5684	5689	100 %	0 %	0 %	0 %	387825561
128	NC_017395	TTC	2	6	5707	5712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825561
129	NC_017395	AAT	2	6	5765	5770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825561
130	NC_017395	ATG	2	6	5802	5807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825561
131	NC_017395	AT	3	6	5810	5815	50 %	50 %	0 %	0 %	387825561
132	NC_017395	A	6	6	5823	5828	100 %	0 %	0 %	0 %	387825561
133	NC_017395	ATA	2	6	5852	5857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825561
134	NC_017395	ATAA	2	8	5862	5869	75 %	25 %	0 %	0 %	387825561
135	NC_017395	ATA	3	9	5924	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825562
136	NC_017395	CT	3	6	5948	5953	0 %	50 %	0 %	50 %	387825562
137	NC_017395	A	7	7	5978	5984	100 %	0 %	0 %	0 %	387825562
138	NC_017395	TA	3	6	5985	5990	50 %	50 %	0 %	0 %	387825562
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